Lebih dikenal dengan nama sekolah Arab. Belajar di madrasah bagi anak-anak Betawi menjadi keharusan, untuk mendapatkan pengetahuan keagamaan dari seorang guru yang lazim disebut ustadz. Perkembangan selanjutnya banyak madrasah yang didirikan lembaga pendidikan, seperti Jamiatul Khair, Al Irsyad, dsb. Perkembangan sekolah madrasah (dan juga pesantren) membawa pengaruh yang sangat besar dalam kehidupan pendidikan Islam di Indonesia, khususnya di Jakarta masa awal abad ke-20. Di antara madrasah yang ada terdapat satu kebiasaan saling bertukar guru, ustadz, atau ulama. Madrasah dan pesantren-pesantren sengaja mengundang salah seorang ulama terkemuka untuk berceramah.